三年制專轉本和五年制專轉本的主要區別在于專科起點的不同、考試地點及院校、考試科目，本科招生院校等方面的不同。

1、專科起點不同三年制大專是以高考為起點，統一參加高考并且過了大專錄取分數線之后，被大專院校錄取，就讀三年，稱為三年制大專。五年制大專是以中考為起點，初中生通過在中專、技校或高職學校里就讀五年，稱為五年一貫制大專。

2、考試地點及院校，三年制專轉本是在專科生三年級第二學期的三月份參加轉本考試，每個城市均設有考點，全省有多個院校可以報考。而五年制專轉本是在五年級第二學期的3月份參加轉本考試，全省只有部分院校可以考，考試通常在主考院校內進行。

3、轉本考試科目不同三年制專轉本考試內容，公共課語文/數學+英語四級/日語四級（最高分折算）+19類專業課（理論150分+技能80分）=500分；五年制專轉本考試內容：校考英語100分+校考專業課一+校考專業課二=300分。

4、本科招生院校不同，三年制專轉本招生院校：50多所本科院校，其中公辦本科占多數，有雙一流院校，如南京信息工程大學/南京林業大學/南京郵電大學；重點公辦本科院校如江蘇大學/南京工業大學/揚州大學/南京審計大學等。五年制專轉本招生院校：約17所本科院校！其中非師范類院校：南京曉莊學院/江蘇第二師范學院/金陵科技學院/南京傳媒學院/南京工業職業技術大學/南京師范大學中北學院/三江學院/南京師范大學泰州學院/淮陰工學院/鹽城工學院/蘇州城市學院/蘇州大學應用技術學院/南通理工學院/南京醫科大學康達學院共十四所。師范類院校：江蘇第二師范學院/常州工學院/泰州學院/鹽城師范學院共四所。

最后友情提醒如果想參加專轉本的學生可以了解一下江蘇瀚宣博大培訓班，蘇瀚宣博大五年制專轉連鎖培訓學校現本面向南京、無錫、南通、揚州、鎮江、蘇州、江陰、宜興、鹽城、淮安、鹽城、常州、徐州、泰州等地區五年制高職院校招生，為學生提供較優質的專業化、系統化、特色化的五年制專轉本培訓的教育服務，根據考試大綱，系統分科目詳細講解各個部分的內容，通過老師的課堂教學，進一步加深各科的內容，起到提綱摯領的作用，在整個教學過程中，將往年考試內容貫穿其中，促進學生取得高分，升入理想院校。

綜上所述，三年制專轉本和五年制專轉本在專科起點的不同、考試的地點及院校、考試科目、本科招生院校等方面存在顯著差異。